第1場
レスボス島では、少年と少女の牧人たちがエロスの神殿に向かって行進している。その途中で、お互いに恋をしている山羊飼いの少年ダフニスと羊飼いの少女クロエが群衆と合流する。少年と少女の間でお互いを盛り上がらせるダンスゲームが始まる。ドルコンはクロエに対する情熱が燃え上がる。ダフニスは、ドルコンがクロエにキスするつもりであることを見て、彼を追い払う。
ドルコンは、クロエに対する感情を情熱的なダンスで表現しようとするが、失敗する。ダフニスはドルコンと対立し、舞踏の腕前を競い合い、クロエの喜びを呼び起こす優雅なダンスを踊る。彼女は彼の唇にキスする。少女にキスされ、若い羊飼いは初めて、奇妙な興奮を感じた。誰もが去り、羊飼いの少女たちはクロエを連れて行く。
ダフニスは一人になるが、そこに彼に恋していたリュセイオンが戻ってくる。彼女はダフニスを魅了しようとするが、やがて、ダフニスは情熱に捕らわれ、誘惑に屈してしまう。
遠くから好戦的な音と悲鳴が聞こえてくる。島を襲来したタナトスの戦士たちが走っている。叫びに駆けつけたダフニスは、戦士たちに誘拐されたクロエを探しているが、失敗する。ダフニスは絶望のあまりで倒れる。
そこにニンフたちが現れ、不幸な少年の涙が彼女たちに触れ、彼女たちはエロスへの助けを求めて祈る。
第2場
タナトスの目覚めた戦士たちは彼らの神を待っている。彼は現れ、誰もが狂ったダンスを踊り始める。戦士たちがクロエを連れてくる。彼女はタナトスに彼女を解放するように頼むが、彼女の祈りは彼の情熱を燃やすだけである。突然、エロスはニンフたちと共に現れ、タナトスと彼の戦士たちを盲目にする。クロエは自由になる。 エロスは彼女のダフニスとの結婚を祝福する。
第3場
ニンフたちはクロエとダフニスの出会いの準備をしている。ダフニスが現れ、クロエに駆けつける。ニンフたちは一緒になった恋人たちを踊らせる。
男子と女子の牧人たちは、彼らの前でパン神のシリンクスに対する愛の思いについて語るパントマイムを演奏する。ニンフたちはダフニスとクロエをダンスに巻き込む。エロスの前に、彼らは永遠にお互いを愛し、決して離れないと誓う。誰もが幸せで、バッカナールに乗り出し、エロスの勝利を祝い始める。