Обучался в Санкт-Петербургской консерватории имени Н.А. Римского-Корсакова и аспирантуре, а также окончил аспирантуру в Эколь Нормаль де Мюзик в Париже.
Свой первый конкурсный Гран-при выиграл в возрасте 15 лет. Затем последовали успешные выступления на других конкурсах, среди которых Международный конкурс высших школ в Такасаки (Япония, I премия и специальный приз), Международный конкурс фортепианной академии, основанной фондом Тео Ливена (Комо, Италия, I премия), Международный конкурс Джордже Энеску (Бухарест, Румыния, II премия), высшие награды на конкурсах в Сернансельи (Португалия) и Ме-Сюр-Сене (Франция).
Активно гастролирует в России, Европе, Японии, Южной Корее, Бразилии. Выступает в лучших залах Санкт-Петербурга, Вигмор-холле (Лондон), Фестшпильхаусе (Баден-Баден), Сити-холле (Гонконг), Дворца Ле Корум (Монпелье), зале Корто и театре де Буфф дю Нор (Париж), замке Нимфенбург (Мюнхен), Казальс-холле (Токио), Арт-центре Пусана (Юж. Корея) и других.
Принимал участие в многочисленных музыкальных фестивалях, в том числе в Люцерне, Харрогейте (Англия), имени Ф. Бузони в Больцано (Италия), имени И. Менухина в Гштааде (Швейцария), Радио Франс в Монпелье (Франция), в Кухмо (Финляндия).
Выступал с оркестрами Государственного Эрмитажа, Государственной академической капеллы Санкт-Петербурга, Академическим симфоническим оркестром филармонии Санкт-Петербурга, оркестром Петрозаводской филармонии, оркестром фестиваля в Куритибе (Бразилия), Филармоническим оркестром Пусана (Юж. Корея). Играл под руководством таких дирижёров, как Михаил Юровский, Жан-Клод Казадезюс, Хуберт Судан, Моше Ацмон, Ави Островский, Дориан Уилсон, Роберт Тревиньо, Александр Анисимов, Карло Палеччи, Эмиль Саймон.
Уже много лет Евгений Изотов тесно сотрудничает с Шопеновским обществом Санкт-Петербурга. Его приглашают на фестивали имени Шопена, «Дни польской культуры в Карелии» (2005, 2008). В 2008 году он записал прелюдии Шопена для CD, выпуск которого был приурочен к 200-летию со дня рождения композитора.
В сентябре 2013 года пианист выступил с сольным концертом в рамках саммита G 20 в Санкт-Петербурге.
В своей исполнительской деятельности артист уделяет большое внимание камерной музыке. В составе Piter’s Trio с Владиславом Песиным (скрипка) и Тарасом Трепелем (виолончель) неоднократно становился призёром международных конкурсов камерной музыки. Также сотрудничает с Сергеем Догадиным (скрипка), Андреем Барановым (скрипка), Леонидом Гороховым (виолончель), Дмитрием Ереминым (виолончель), квартетом «Атриум», квартетом имени К. Шимановского. В настоящее время много выступает в дуэте с Валерием Соколовым (скрипка).
Пианист успешно сочетает интенсивную концертную деятельность с педагогической. Является доцентом кафедры специального фортепиано в Санкт-Петербургской консерватории, с 2008 года — также приглашённым профессором по классу фортепиано в Пусанском университете Silla (Юж. Корея).
Концерты Евгения Изотова транслировались на телеканалах Mezzo, MBC в Южной Корее, на Radio France, BBC Radio и Радио России Санкт-Петербург.