Евгения Акишина родилась в городе Волжский Волгоградской области. В 2008 году окончила Волгоградский институт искусств им. П.А. Серебрякова (класс преподавателя Натальи Моисеевны Вяткиной). В 2014 году — аспирантуру Ростовской государственной консерватории им. С.В. Рахманинова (творческий руководитель — заслуженная артистка РФ, профессор Маргарита Петровна Черных).
С 2006 года работала артистом оркестра Волгоградского музыкального театра. В составе оркестра принимала участие в гастрольных поездках театра по городам России и выступлениях коллектива в концертных и фестивальных программах.
В 2012 году была приглашена на должность концертмейстера оперной труппы в театр «Царицынская опера» города Волгограда. За годы работы принимала участие в постановках спектаклей: «Тоска», «Богема», «А зори здесь тихие» и др.
В 2015 и 2017 годах принимала участие в постановке опер «Сестра Анжелика» Пуччини и «Так поступают все» Моцарта на фестивале International Lyric Academia in Roma&Viterbo (Италия). В 2019 году в качестве концертмейстера принимала участие в мастер-классах для молодых оперных певцов заслуженной артистки РФ Марии Шагуч (Прага, Чехия).
С 2017 года — концертмейстер оперной труппы Приморской сцены Мариинского театра. Участвует в подготовке и выпуске спектаклей театра текущего репертуара, а также Международного Дальневосточного фестиваля «Мариинский» во Владивостоке. В 2018 году в качестве ответственного концертмейстера участвовала в подготовке оперного спектакля «Мавра» Стравинского для фестиваля «Звёзды белых ночей» в Санкт-Петербурге. Принимает участие в камерных концертах и спектаклях Малой сцены театра.
